![\"\"](\"https://thebibliomagician.wordpress.com/wp-content/uploads/2019/07/c-cby-1.png\")
Unless it states otherwise, the content of the Bibliomagician is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.Jeffrey Demaine & Philippe Boisvert
\n\n\n\nA review of a recent article on bibliographic coupling (BC) and conceptual similarity prompted reflection among members of a bibliometrics reading group. In this piece, they examine the validity of BC as a measure of semantic similarity, unpack the article's methodology, and discuss its conclusions, considering the broader implications of using BC to capture the semantic content of cited works.
\n\n\n\nAs part of a monthly reading club hosted by Philippe Boisvert of the Universit\u00e9 Laval, a few bibliometricians reviewed the article Bibliographic Coupling and Conceptual Similarity: Are the Bibliographically Coupled Papers also Conceptually Similar? This research by Nandy et al. (2024) casts doubt on the validity of Bibliographic Coupling (BC) as a method of capturing the semantic content of cited articles. It should be noted that questions about the usefulness of BC in identifying any meaningful relationship between publications dates back several decades. The article in question does a good job of reviewing previous studies that both support and refute the validity of BC as a measure of semantic similarity. Yet for those of us who have used BC for years, the article's conclusions are surprising.
\n\n\n\n\n\n\n\n\nBibliographic Coupling
\n
Originally proposed by Michael Kessler in 1963, the rationale behind Bibliographic Coupling (\"BC\") is simple: the more references that two articles have in common, the more likely the contents of the articles are similar. This can be measured simply by counting the number of references they share (known as \"BC strength\"). It can also be expressed as a fraction by dividing the number of overlapping references by the sum of all the unique references in the two articles (the \"Jaccard Similarity Index\").
Although it involves the manipulation of large matrices, the methodology is straightforward. The normalized Jaccard Similarity is calculated for all pairs of publications, both for BC and for a \"concept coupling\" score derived from the Dimensions database. The resulting matrices (document X document; document X concept) were then filtered to extract pairs of publications that are related both through BC and concepts, and the Jaccard Similarity values of these pairs were compared. Somewhat controversially, the authors find no correlation between the BC scores and the \"concept coupling\" weights assigned by Dimensions.
\n\n\n\nThankfully, a close reading of the details of the methodology uncovered a couple of weaknesses in the analysis that may help to explain this unexpected finding:
\n\n\n\nWhile the results presented in the article would seem to present a strong case against the meaningfulness of BC, the take-home message might be that, despite decades of use, it seems that the jury is still out. Clearly, BC is measuring something different than the concepts expressed in the Dimensions database. Perhaps both are equally valid measures of document similarity, but in completely separate ways.
\n\n\n\nConsider an analogy: the similarity of cities can be calculated based on the flight networks that connect them. It can be said that L.A. and Vancouver are coupled (from an airline's point of view) because there are direct flights to Tokyo from both. Yet the socio-economic characteristics of each city (perhaps analogous to the conceptual content of an article) are quite different. Thus, while the article by Nandy et al. (2024) demonstrates that BC and conceptual coupling are incomparable, this should not be taken as discrediting the usefulness of BC in expressing the structural or topical relatedness of publications. A prudent bibliometrician would use BC in conjunction with other measures of textual similarity.
\n\n\n\nJeffrey Demaine is an organizer of the annual Bibliometrics and Research Impact (BRIC) conference. He has extensive experience in information science, beginning with the National Research Council in Ottawa, and then the iFQ in Germany. His publications have focused on leveraging metadata to uncover patterns in research and higher education, such as Linked Literature Analysis, gender distribution across faculties and institutions, and the fractionalization of citation impact. He was the Bibliometrics and Research Impact Librarian at the University of Waterloo and McMaster University.
\n\n\n\nPhilippe Boisvert has been the Bibliometrics and Research Impact Librarian at Universit\u00e9 Laval in Quebec City, Canada, since 2022. Before that, he was a subject librarian in science and engineering since 2010. In that role, he has been involved in bibliometrics since 2014. He also has a background in Physics (a master's degree and a PhD candidature for more than two years). Since 2023, he has been running the monthly reading club of the Canadian Association of Research Libraries BIR CoP. He's also been on the Steering Committee of that CoP since that year.
\n\n\n\n Unless it states otherwise, the content of the Bibliomagician is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
DOI: https://doi.org/10.59350/bwz65-rjn21
","doi":"https://doi.org/10.59350/vmshw-eqe18","guid":"https://thebibliomagician.wordpress.com/?p=5260","language":"en","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1775001600,"reference":[{"id":"https://doi.org/10.1002/asi.5090140103","unstructured":"Kessler, M.M. (1963), Bibliographic coupling between scientific papers. American Documentation, 14: 10-25."},{"id":"https://doi.org/10.5530/jscires.20041115","unstructured":"Nandy, A., Singh, A., Gupta, V., & Singh, V. K. (2024). Bibliographic Coupling and Conceptual Similarity: Are the Bibliographically Coupled Papers also Conceptually Similar? Journal of Scientometric Research, 13(3), 706\u2013714."}],"rid":"4ktpw-xyx07","summary":"Jeffrey Demaine & Philippe Boisvert A review of a recent article on bibliographic coupling (BC) and conceptual similarity prompted reflection among members of a bibliometrics reading group.","tags":["Bibliometric","Bibliometric Study","Metrics"],"title":"A Review of \"Comparing Bibliographic Coupling and Conceptual Similarity\" \u2013 Have We Been Wrong All Along?","updated_at":1788683479,"url":"https://thebibliomagician.wordpress.com/2026/04/01/a-review-of-comparing-bibliographic-coupling-and-conceptual-similarity-have-we-been-wrong-all-along/","version":"v1"}},{"document":{"authors":[{"contributor_roles":[],"family":"Price","given":"Robyn"}],"blog":{"authors":[{"name":"Bibliomagician Staff"}],"community_id":"f5c1522e-c8de-4681-a317-e32ddb61b26a","created":1780876800,"current_feed_url":null,"description":"Comment & practical guidance from the LIS-Bibliometrics community","doi":"https://doi.org/10.59350/bibliomagician","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/f5c1522e-c8de-4681-a317-e32ddb61b26a/logo","feed_format":"application/atom+xml","feed_url":"https://thebibliomagician.wordpress.com/feed/atom","filter":null,"generator":"WordPress.com","home_page_url":"https://thebibliomagician.wordpress.com","issn":null,"language":"eng","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"bibliomagician","status":"active","subfield":"3309","title":"The Bibliomagician","updated":1788480121,"use_api":true},"blog_name":"The Bibliomagician","blog_slug":"bibliomagician","content_html":"Robyn Price considers how systematic injustices in academia are present in and perpetuate in bibliometrics; and ways that the bibliometric community can address this.
\n\n\n\nWorking in bibliometrics is difficult. The part that I, and I think a lot of people in this community, find difficult is the responsibility for data about research outputs and the people who produce research.
\n\n\n\nBibliometrics requires applying an agreed value system on to the research outputs, and thus on to the people. In this recent week of global action and anger against systematic racism amid the backdrop of health and economic crisis, this difficulty has weighed on me more heavily than ever.
\n\n\n\nWe try to count a real world of people (in the UK alone, HESA counts over 210,000 working academics employed in 2018/19[1]), the organisations that employ them and the research they produce. So much of traditional research evaluation depends on this research being in the hegemonic output type (journal articles).
\n\n\n\nJournal articles are a data entity that we analyse in search of a larger narrative about production or performance of research. This is something that in reality is complicated and not always accurate: co-authorship might or might not depict real collaboration and knowledge sharing between researchers; the discipline associated with the journal might or might not depict the exact intellectual space this work contributes to; the listed authors and their authorship position might or might not relay the real story of how or by whom the work was created.
\n\n\n\nThis gap between bibliographic data and the complex reality of what it represents will be familiar to anyone who works in this area. I have been further considering how this gap between the data and the reality, the 'known unknown' that we accept when using journal articles as a proxy for telling a human story of research, is exacerbated by issues of power structures and unequal representation in academia. This link was clarified to me through a discussion with Professor Chris Jackson (Imperial College London) who spoke of his perception and experience of structural biases in academia that perpetuate biases in the academic value system.
\n\n\n\n![\"\"](\"https://thebibliomagician.wordpress.com/wp-content/uploads/2020/06/tingey-injury-law-firm-ycdpu73kgsc-unsplash.jpg?w=1024\")
How can you 'assess the impact' of an article without knowing the ways authors might have benefited from or have been disadvantaged, or even been excluded entirely, by systematic inequities that the article data can never tell you? Some of the ways we treat bibliographic data directly strengthen biases. An example of this is using databases that we know to have biases, such as language[3] or geography, for analysis.
\n\n\n\nThese limitations can be seen even when we just begin to identify researchers and their outputs; the publication databases falling short of identifying outputs from all of our researcher cohorts equally before we even start to derive metrics, responsible or otherwise, from them.
\n\n\n\nHow can the bibliometric community tackle these issues? I have begun to consider how individuals in positions like me have responsibility for stopping these issues perpetuating in our practice and community. What practical things can those in such positions do to help address these issues?
\n\n\n\nI invite anyone with other ideas of ways to address this issue, or who wish to share experiences or further reading material to contribute through the comments or on the list.
\n\n\n\n[1] https://www.hesa.ac.uk/data-and-analysis/staff/working-in-he
\n\n\n\n[2] https://www.theguardian.com/education/2019/sep/12/look-at-how-white-the-academy-is-why-bame-students-arent-doing-phds
\n\n\n\n[3] https://arxiv.org/abs/2005.10732
\n\n\n\n[4] Ishaq, Dr M and Hussain, Dr AM (2019). BAME staff experiences of academic and research libraries. London: SCONUL https://www.sconul.ac.uk/page/bame-staff-experiences-of-academic-and-researchlibraries
\n\n\n\n![\"\"](\"https://thebibliomagician.wordpress.com/wp-content/uploads/2019/06/photo-2.jpg?w=525\")
Robyn is the Bibliometrics and Indicators Manager at Imperial College London. In this role she is responsible for managing a bibliometrics service with an emphasis on promoting responsible use of metrics. Previously, Robyn worked in the editorial teams of subscription and open access journals.
\n\n\n\n\nUnless it states other wise, the content of the Bibliomagician is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
\nDOI: https://doi.org/10.59350/bibliomagician.3582
","doi":"https://doi.org/10.59350/bibliomagician.3582","guid":"https://thebibliomagician.wordpress.com/?p=3582","image":"https://thebibliomagician.wordpress.com/wp-content/uploads/2020/06/tingey-injury-law-firm-ycdpu73kgsc-unsplash.jpg?w=1024","language":"en","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1591660800,"rid":"hc780-x4107","summary":"Robyn Price considers how systematic injustices in academia are present in and perpetuate in bibliometrics; and ways that the bibliometric community can address this. Working in bibliometrics is difficult.","tags":["Bibliometrician","Equality And Diversity","Metrics"],"title":"Truth behind the numbers?","updated_at":1788679940,"url":"https://thebibliomagician.wordpress.com/2020/06/09/the-truth-behind-the-numbers/","version":"v1"}},{"document":{"authors":[{"affiliation":[{"id":"https://ror.org/0153tk833","name":"University of Virginia"}],"contributor_roles":[],"family":"Turner","given":"Stephen","url":"https://orcid.org/0000-0001-9140-9028"}],"blog":{"authors":[{"name":"Stephen Turner"}],"community_id":"382941a7-2ffa-41df-8bbb-5f772188517f","created":1780876800,"current_feed_url":null,"description":"A practicing data scientist's take on AI, genomics, biosecurity, and the ways AI is reshaping how science gets done. Weekly updates from the field. Occasional notes on programming.","doi":"https://doi.org/10.59350/stephenturner","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/382941a7-2ffa-41df-8bbb-5f772188517f/logo","feed_format":"application/rss+xml","feed_url":"https://blog.stephenturner.us/feed","filter":null,"generator":"Substack","home_page_url":"https://blog.stephenturner.us","issn":null,"language":"eng","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"stephenturner","status":"active","subfield":"1311","title":"Paired Ends","updated":1788599012,"use_api":null},"blog_name":"Paired Ends","blog_slug":"stephenturner","content_html":"![\"\"](\"https://substackcdn.com/image/fetch/$s_!v20i!,f_auto,q_auto:good,fl_progressive:steep/https%3A%2F%2Fsubstack-post-media.s3.amazonaws.com%2Fpublic%2Fimages%2F129d7746-6eee-45f6-be54-5dd354abb5e1_2000x1050.png\")
I published a preprint last week. It mostly focuses on what biosecurity evaluations of AI models measure and how far those measurements sit from what you might call an estimate of real-world risk.
AI Biosecurity Benchmarks and Real-World Risk (2026). Available at SSRN: https://ssrn.com/abstract=7358438 or dx.doi.org/10.2139/ssrn.7358438
I've spent about 15 years in and adjacent to biodefense. At first as an academic researcher when I got my first faculty position here in the School of Medicine, then for many years at Signature Science where the badge said industry but the work was for the US government. Now I'm back in academia at the UVA School of Data Science, building out our own AIxBio and biosecurity research program along with other colleagues here at SDS and in our National Security Data and Policy Institute.
Over the past year since I returned to UVA I've been closely following the AIxBio and biosecurity literature: new benchmarks/evals, human uplift trials, synthesis screening results, unlearning and pretraining-filter experiments, developer preparedness frameworks, policy proposals. My thinking was that the many pages of notes on the important work happening here could be a starting point for developing a really interesting upper level elective or graduate course here in SDS. Many of these notes became posts here on this newsletter. The rest piled up in my Zotero library, full of notes and highlights attached to each of the entries. I decided to package up everything I had into a single review, mostly on the theme of how benchmark scores connect to real-world risk and what work remains to be done. I started writing this mostly as a primer for new people joining my lab, but then figured it may be of broader interest.
The list of groups doing this work or funding it is long, and the reference list includes work from Active Site, SecureBio, Sentinel Bio, Signature Science, IBBIS, LatchBio, RAND Center on AI, Security, and Technology (CAST), Hewlett Foundation, Johns Hopkins Center for Health Security, METR, Epoch AI, UK AI Security Institute, Frontier Model Forum, Nuclear Threat Initiative, International Gene Synthesis Consortium, Sequence Biosecurity Risk Consortium, Aclid, Centre for Long-Term Resilience, NIST Center for AI Standards and Innovation (CAISI), Georgetown CSET, all the frontier labs, and many, many others.
I don't love offering a TL;DR on a review paper since synthesizing all the interesting bits from hundreds of papers is kind of the whole point of writing one. But it might just be TL, so in case you DR, here's a one-line summary:
Really great people at really great organizations are doing really great work at the intersection of AI and biosecurity.
I tried to organize as much of it as I could into one place, with sincere apologies to anyone whose work in this space I omitted.1 If you'd be willing to peer review this when I try to publish it, email me.
And even more sincere apologies to any work I cited here but mischaracterized. The last page of the paper has the most detailed AI disclosure I've ever read or written. On an early draft I gave an army of Claude agents the manuscript Quarto file, full access to my Zotero library and PDF exports alongside the BiBTeX file with everything I cited, and asked for rigorous fact checking of everything I wrote and every statistic I cited. It worked well, until it didn't \u2014 because of the nature of the subject matter being biosecurity and discussion of dual-use technology, adversarial red-teaming, safeguards, screening evasion, etc., I ended up hitting refusals from nearly every model I attempted to use in this fact-checking agentic workflow. I eventually gave up and did the fact-checking and proofreading the old fashioned way (re-reading, and re-re-reading), but I'm human and I make human mistakes. Hopefully anything I didn't catch will get surfaced during peer review. See the last page of the paper for details.
Il y a deux ans environ, le projet Zotero a obtenu une bourse pour
Nous relayons ici
Nous vous l'annoncions il y a quelques mois: le nouveau bouton de\ncapture, qui venait d'\u00eatre\nmis en place sur Firefox, allait \u00eatre mis en place pour d'autres\nnavigateurs. C'est d\u00e9sormais chose faite pour Google Chrome\u00a0! (Les\nutilisateurs de Safari doivent encore patienter un peu.)
\n\u00c0 noter: Ce billet est une adaptation de l'
Petit rappel : jusque-l\u00e0, si l'extension Zotero pour Chrome d\u00e9tectait\nune r\u00e9f\u00e9rence sur une page web, il affichait une ic\u00f4ne dans la barre\nd'adresse. Pour les pages sur lesquelles l'extension ne pouvait pas\ntrouver de r\u00e9f\u00e9rences, on pouvait faire un clic droit sur la page et\nchoisir \u00abSave Page to Zotero\u00bb, pour ajouter un document Page\nWeb et une capture dans sa biblioth\u00e8que.
\nDepuis la derni\u00e8re version de l'extension Chrome, il est possible\nd'utiliser le m\u00eame bouton, qui figure en permanence dans la\nbarre d'outils, pour enregistrer un document depuis n'importe quelle\npage :
\nSi l'extension d\u00e9tecte une r\u00e9f\u00e9rence, le bouton affiche la m\u00eame ic\u00f4ne\nque par le pass\u00e9: un livre, un journal, un article de revue, un dossier,\netc. Sur toute autre page, vous verrez une ic\u00f4ne grise qui permettra\nl'enregistrement d'un document Page Web, avec une capture et les\ninformations les plus basiques la concernant (titre, URL, date de\nconsultation).
\nCe bouton unique et simplifi\u00e9 constitue l'avantage principal apport\u00e9\npar cette mise \u00e0 jour. Deux autres nouveaut\u00e9s font leur apparition.
\nD'une part, un menu d\u00e9roulant permet de choisir d'autres\nmani\u00e8res d'importer les r\u00e9f\u00e9rences. En g\u00e9n\u00e9ral, le clic sur le\nbouton reste la meilleure solution. Dans certains cas, le menu d\u00e9roulant\napporte quelques avantages, que vous pouvez d\u00e9couvrir dans le billet que\nnous avions consacr\u00e9 \u00e0 la version Firefox:
D'autre part, il est d\u00e9sormais possible d'enregistrer un PDF\ndans Zotero par un seul clic.
\nJusque-l\u00e0, l'enregistrement d'un PDF n\u00e9cessitait de le faire glisser\ndepuis la barre d'adresse pour le d\u00e9poser dans Zotero ou de\nl'enregistrer en local, puis de l'ajouter manuellement dans Zotero.\nD\u00e9sormais, lorsque vous affichez un fichier PDF dans Chrome, il vous\nsuffit de cliquer sur le nouveau bouton de capture dans la barre\nd'outils pour enregistrer le PDF dans Zotero.1\nIl est cependant import\u00e9 comme simple fichier PDF, sans \u00eatre attach\u00e9 \u00e0\nune r\u00e9f\u00e9rence bibliographique plus compl\u00e8te. Pour cr\u00e9er une telle\nr\u00e9f\u00e9rence, vous pouvez soit tenter de \u00abR\u00e9cup\u00e9rer les m\u00e9tadonn\u00e9es du\nPDF\u00bb, soit \u00abCr\u00e9er un document parent\u00bb \u00e0 remplir manuellement. Ces deux\noptions sont accessibles par un clic-droit sur le PDF. Dans une\nprochaine version, Zotero tentera de cr\u00e9er un \u00e9l\u00e9ment parent\nautomatiquement.
\nEn d\u00e9pit du nouveau bouton, certaines limitations\npersistent. Notons en deux. Premi\u00e8rement, tant que la page web\nn'a pas fini de charger dans Chrome, l'extension Zotero n'affiche que\nl'ic\u00f4ne grise de capture de page web, m\u00eame si la page contient une ou\nplusieurs r\u00e9f\u00e9rences bibliographiques. Deuxi\u00e8mement, la capture de page\nweb ne fonctionne pas si Zotero Standalone n'est pas ouvert. L\u00e0 aussi,\nune am\u00e9lioration est pr\u00e9vue et une future version permettra\nd'enregistrer des pages web directement dans votre compte zotero.org\nquand Standalone n'est pas ouvert (comme c'est d\u00e9j\u00e0 le cas pour les\nautres types de r\u00e9f\u00e9rences).
\nSi vous avez install\u00e9 la derni\u00e8re version de Chrome, votre extension\nZotero devrait \u00eatre mise \u00e0 jour automatiquement. Si vous n'utilisez pas\nactuellement Zotero avec Chrome, vous pouvez
1. \u00c0 condition toutefois que vous disposiez de\nla version 4.0.29 ou sup\u00e9rieure de Zotero Standalone.
Lorsque vous enregistrez des documents dans Zotero, toutes les\ninformations ne sont pas forc\u00e9ment bien format\u00e9es, et il est parfois\nn\u00e9cessaire de proc\u00e9der \u00e0 des corrections manuelles. Zotero permet\nd'effectuer tr\u00e8s facilement de petites retouches.
\nNous allons alors voir :
\nLes options d'inversion du nom/pr\u00e9nom et de modification de la casse\ndu titre s'affichent par un simple clic-droit (ctrl + clic\ngauche pour les utilisateurs de Mac) dans le contenu des champs\nconcern\u00e9s.
\nCette fonctionnalit\u00e9 est disponible pour tous les champs de type\nauteur (y compris Auteur du livre, \u00c9diteur, Traducteur, Compositeur,\netc).
\nLa \u00ab\u00a0Bo\u00eete \u00e0 outils des historiens\u00a0\u00bb a pr\u00e9sent\u00e9 en 2011
![\"undefined\"](\"https://thebibliomagician.wordpress.com/wp-content/uploads/2020/06/orcid-id_icon-16x16-1.png\"){kind=icon}
<i> et </i> pour des\nitaliques<b> et </b> pour mettre en\ngras<sub> et </sub> pour mettre en\nindice<sup> et </sup> pour mettre en\nexposant<span style=\"font-variant:small-caps;\"> et\n</span> pour mettre en petites majusculesSoulignons que ces modifications s'envisagent uniquement pour une\npartie d'un champ : c'est par exemple utile si le titre d'un article\ncite le titre d'un ouvrage, qui devrait donc figurer en italique. En\nrevanche, si vous souhaitez que l'ensemble du titre soit en italique,\nchoisissez un style bibliographique pr\u00e9voyant ce type de formatage, ou\ncr\u00e9ez-en un int\u00e9grant ce param\u00e8tre.
\nDans un pr\u00e9c\u00e9dent billet du blog, nous avons d\u00e9j\u00e0 pr\u00e9sent\u00e9\nl'existence d'une fonctionnalit\u00e9 permettant de corriger la casse des\nchamps de type titre, tels que \u00ab\u00a0Titre abr\u00e9g\u00e9\u00a0\u00bb, \u00ab\u00a0Titre du livre\u00a0\u00bb,\n\u00ab\u00a0Publication\u00a0\u00bb, etc. Cette fonctionnalit\u00e9 a comme utilit\u00e9 d'appliquer\nune r\u00e8gle de majuscules choisie.
\nLe menu affich\u00e9 au clic-droit (ctrl + clic gauche pour les\nutilisateurs de Mac) propose deux options :
\nRappelons que Zotero est une base de donn\u00e9es, et\nqu'\u00e0 ce titre elle n'a pas vocation \u00e0 traiter la mise en\nforme, mais \u00e0 stocker du contenu. Ce contenu\npourra ensuite \u00eatre mis en forme gr\u00e2ce aux styles bibliographiques CSL.\nDans cette perspective, afin que la mise en forme automatique param\u00e9tr\u00e9e\npar le style bibliographique soit la plus homog\u00e8ne et syst\u00e9matique, on a\ntout int\u00e9r\u00eat \u00e0 stocker aussi un contenu le plus homog\u00e8ne possible. Le\nrisque est sinon de cr\u00e9er des exceptions dont le style ne tiendra pas\ncompte, ce qui engendrera des anomalies qu'il faudra corriger \u00e0 la\nmain.
\nL'option \u00ab\u00a0Transformer le texte\u00a0\u00bb permet ainsi non seulement de\ncorriger des erreurs manifestes de typographie (lorsque le champ a \u00e9t\u00e9\nimport\u00e9 tout en capitales par exemple), mais aussi d'uniformiser le\nformatage d'un champ commun \u00e0 tous les enregistrements, en l'occurrence\ntout champ de type \u00ab\u00a0Titre\u00a0\u00bb.
\nCette option permet aussi d'offrir une solution de compromis aux\nutilisateurs qui souhaitent apporter des retouches ponctuelles \u00e0\ncertains titres de leur biblioth\u00e8que, sans pour autant modifier le\nparam\u00e9trage du style CSL utilis\u00e9 (voir le Bonus ci-dessous).\nC'est une mani\u00e8re d'introduire un peu de mise en forme dans les\ninformations contenues dans la base.
\nTout comme les consignes des \u00e9diteurs, les conventions typographiques\n(qui d\u00e9pendent en grande partie de diff\u00e9rentes cultures linguistiques)\nsont tr\u00e8s diverses. Pour cette raison, dans la plupart des cas, les\nstyles CSL ne s'occupent pas de mettre en forme la casse des titres, de\nfa\u00e7on \u00e0 laisser \u00e0 chacun la possibilit\u00e9 d'indiquer sa pr\u00e9f\u00e9rence au cas\npar cas lors de l'enregistrement de chacune des r\u00e9f\u00e9rences.
\nDonc, \u00e0 moins que vous n'envisagiez de modifier ce fonctionnement\npour un des styles que vous utilisez (voir le Bonus\nci-dessous), la solution la plus simple consiste \u00e0 placer les capitales\ndu titre selon votre convenance. De cette mani\u00e8re, vous serez s\u00fbr de les\nvoir appara\u00eetre tels quels dans vos bibliographies. Concr\u00e8tement, en\nfran\u00e7ais, le mode phrase s'av\u00e9rera dans la quasi\ntotalit\u00e9 des cas le meilleur choix, \u00e9ventuellement corrig\u00e9 \u00e0 la main\npour les noms propres, et ponctuellement combin\u00e9 avec le mode\ntitre pour les r\u00e9f\u00e9rences anglophones.
\nIl est aussi possible d'utiliser les styles CSL pour prendre en\ncharge la casse du titre. Nous abordons l\u00e0 un domaine, la modification\ndes styles CSL, qui peut \u00eatre \u00e9tranger \u00e0 certains d'entre vous et vous\nsembler, sinon \u00e9sot\u00e9rique, du moins trop informatique pour vous. Or il\nn'est nul besoin de comp\u00e9tences informatiques particuli\u00e8res pour\nmodifier et cr\u00e9er des styles CSL, mais d'un peu de temps et de patience\npour se familiariser avec le langage CSL, bas\u00e9 sur XML. Des ressources\nen ligne peuvent vous aider \u00e0 d\u00e9buter :
\nSi vous d\u00e9butez, utiliser l'\u00e9diteur de styles int\u00e9gr\u00e9 \u00e0 Zotero\nlimitera les mauvaises manipulations qui peuvent rendre un style\ninutilisable ou incoh\u00e9rent (balise mal ferm\u00e9e ou incompatibilit\u00e9\nd'instruction par exemple).
\nSi vous choisissez d'assurer la gestion de la casse des titres gr\u00e2ce\nau param\u00e9trage de vos styles CSL, la r\u00e9ponse \u00e0 la question \"Quelle\noption choisir en d\u00e9finitive?\" change alors. Il convient dans ce cas de\n:
\nRentrons dans le vif du sujet. Un param\u00e8tre du style bibliographique\nCSL, l'attribut text-case avec pour valeur\ntitle, permet d'appliquer le mode titre\nlors de la r\u00e9daction. Et il s'av\u00e8re bien plus simple de fonctionner dans\nce sens, i. e. stockage en mode phrase et\nr\u00e9daction en mode titre si n\u00e9cessaire, que dans\nl'autre. Dans l'autre sens vous perdrez en effet, lorsque vous r\u00e9digerez\nen mode phrase, les majuscules \u00e0 l'initiale des noms\npropres. L'attribut text-case valeur sentence\nremplacera en effet toutes les majuscules initiales par des minuscules,\ny compris celles des noms propres.
Nous avons traduit ici approximativement les recommandations de la
CSL processors don't recognize proper nouns. As a result, strings\nin sentence case can be accurately converted to title case, but not vice\nversa. For this reason, it is generally preferable to store strings such\nas titles in sentence case, and only use text-case if\na style desires another case.
\nSoulignons que la conversion ne prend en compte que les cha\u00eenes de\ncaract\u00e8re en anglais et ignore les mots vides tels que \u00ab\u00a0and\u00a0\u00bb, \u00ab\u00a0the\u00a0\u00bb,\netc. Comment Zotero identifie-t-il les cha\u00eenes de caract\u00e8re comme en\nanglais et donc \u00e0 convertir\u00a0? Sont consid\u00e9r\u00e9s comme en anglais tous les\nmots d'une r\u00e9f\u00e9rence bibliographique\u00a0:
\n| \n | \n |
Ajoutons que l'attribut text-case n'a pas pour seules\nvaleurs possibles title et sentence. Il peut\n\u00e9galement \u00eatre qualifi\u00e9 par les valeurs suivantes.
![](\"http://zotero.hypotheses.org/files/2015/07/titre_cell.png\"\ntarget=\"_blank\"){kind=link}
![](\"http://zotero.hypotheses.org/files/2015/07/titre_mla.png\"\nrel=\"attachment){kind=link}
lowercase : restitue le texte en lettres de\nbas-de-casse.uppercase : restitue le texte en lettres\ncapitales.capitalize-first : le premier caract\u00e8re du premier mot\nest restitu\u00e9 par une lettre capitale si le mot est en bas-de-casse ; les\nautres lettres capitales pr\u00e9sentes dans le titre sont conserv\u00e9es.\nL'attribut text-case=\"sentence\" supprime ces capitales pour\nne conserver que celle initiale.capitalize-all : les initiales de tous les mots sont\nrestitu\u00e9es en lettres capitales, y compris celles des mots vides, \u00e0 la\ndiff\u00e9rence de l'attribut text-case=\"title\" qui ignore les\nmots vides.Mais la modification d'un style bibliographique est un autre sujet,\ndans lequel nous avons fait une br\u00e8ve incursion avec l'attribut\ntext-case, et que nous aurons s\u00fbrement l'occasion d'\u00e9voquer\nprochainement. Quelles sont vos attentes en la mati\u00e8re\u00a0? Sur quels\npoints souhaitez-vous des \u00e9clairages ou des conseils\u00a0?
\u00a0
","doi":"https://doi.org/10.59350/6cwc1-tyy80","guid":"http://zotero.hypotheses.org/?p=760","image":"https://zotero.hypotheses.org/files/2015/07/daniel_kulinski.jpg","language":"fr","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1473206400,"rid":"jmxv7-w9e29","summary":"Auteur : Daniel Kulinski \u2013 CC-BY-NC-SA \u2013 Source : Flickr Lorsque vous enregistrez des documents dans Zotero, toutes les informations ne sont pas forc\u00e9ment bien format\u00e9es, et il est parfois n\u00e9cessaire de proc\u00e9der \u00e0 des corrections manuelles. Zotero permet d'effectuer tr\u00e8s facilement de petites retouches.","tags":["Styles Et CSL","Trucs Et Astuces"],"title":"Nettoyer les r\u00e9f\u00e9rences collect\u00e9es, quelques astuces","updated_at":1788666758,"url":"https://zotero.hypotheses.org/760","version":"v1"}},{"document":{"authors":[{"contributor_roles":[],"name":"Collectif"}],"blog":{"authors":null,"community_id":"310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49","created":1708300800,"current_feed_url":null,"description":null,"doi":"https://doi.org/10.59350/zotero_fr","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49/logo","feed_format":"application/atom+xml","feed_url":"https://zotero.hypotheses.org/feed/atom/","filter":null,"generator":"WordPress","home_page_url":"https://zotero.hypotheses.org","issn":null,"language":"fra","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"zotero_fr","status":"active","subfield":"1710","title":"Le blog Zotero francophone","updated":1788191754,"use_api":true},"blog_name":"Le blog Zotero francophone","blog_slug":"zotero_fr","content_html":"![\"image_zotero\"](\"http://zotero.hypotheses.org/files/2016/10/alexandra_guerson_by_nc_nd.jpg\")
Auteur : Alexandra guerson – CC-BY-NC-ND – Source : Flickr
S’informer en ligne en lisant les blogs ou en consultant les forums, c’est bien. Mais se rencontrer, c’est souvent tr\u00e8s b\u00e9n\u00e9fique. Dans cet esprit, nous vous signalons un \u00e9v\u00e9nement organis\u00e9 \u00e0 la fin du mois \u00e0 Paris.
\nA l’occasion de la Semaine internationale du libre acc\u00e8s, l’association HackYourPhD consacre l’un de ses ateliers OpenGeek \u00e0 Zotero. Au cours de cette s\u00e9ance de “culture g\u00e9n\u00e9rale geek” de 2h vous pourrez ainsi :
\nPour participer, inscrivez-vous sur Eventbrite et rendez-vous \u00e0 la Paillasse au sous-sol (226 rue St Denis 75002 Paris) le samedi 29 octobre \u00e0 partir de 16h30 avec C\u00e9lya Gruson-Daniel comme formatrice.
\nMise \u00e0 jour du 25 novembre 2016 : Retrouvez sur GitHub la fiche r\u00e9capitulative de la s\u00e9ance, avec un tr\u00e8s riche exemple d’organisation de biblioth\u00e8que Zotero et de nombreux liens vers des ressources.
\n![\"logo_hyphd\"](\"http://zotero.hypotheses.org/files/2016/10/logo_hyphd.png\"){kind=logo}
Logo cr\u00e9\u00e9 par Geoffroy Dorne
Mise \u00e0 jour du 2022-10-10 :\nSix ans presque jour pour jour apr\u00e8s la publication de ce billet,\nnous fermons les commentaires. Ce billet indique en effet comment\ntrouver de l'aide :
\nDes lecteurs du billet, probablement arriv\u00e9s suite \u00e0 une\nrecherche d'aide sur un moteur de recherche, posant souvent des\nquestions pr\u00e9cises dans les commentaires, nous fermons ces derniers. Le\nforum Zotero, contrairement aux commentaires de ce blog, permet la\nconstruction d'une base commune de connaissances.
\nMise \u00e0 jour du 2020-06-20 : la\ntraduction fran\u00e7aise de la page \"
Mise \u00e0 jour du 2018-09-26 : nous vous\nrecommandons de lire \u00e0 la suite de ce billet la page\u00a0
Auteur : Dennis Skley \u2013 CC-BY-ND \u2013 Source : Flickr
\nQue l'on soit un utilisateur d\u00e9butant ou averti de Zotero, il nous\narrive tous \u00e0 un moment ou \u00e0 un autre de ne pas trouver de r\u00e9ponse \u00e0 une\nquestion li\u00e9e \u00e0 l'utilisation du logiciel. Nous vous proposons ici\nquelques pistes pour trouver l'aide la plus adapt\u00e9e.
\nLe site officiel Zotero propose une abondante documentation qui\ndevrait r\u00e9pondre \u00e0 la plupart de vos questions si vous d\u00e9butez. La\nmajeure partie de la documentation est disponible
Dans le menu de Zotero, cliquer sur Assistance et\ndocumentation vous am\u00e8ne sur la page d'accueil de cette\ndocumentation.
\nPasser par le menu de Zotero renvoie sur zotero.org/support
\nIl est rare que l'on soit le premier \u00e0 \u00eatre confront\u00e9 \u00e0 la difficult\u00e9\nqui nous bloque ou \u00e0 l'interrogation qui nous est venue, qu'il s'agisse\nd'un param\u00e9trage pour l'enregistrement des PDF (comment enregistrer\ntoujours les PDF haute r\u00e9solution sur la plateforme de l'ACS\u00a0?) ou d'un\nstyle bibliographique (comment mentionner le titre d'un num\u00e9ro sp\u00e9cial\ndans la r\u00e9f\u00e9rence d'un article\u00a0?). Le
Enfin, bien souvent, si des bugs vous semblent appara\u00eetre suite \u00e0 une\nmise \u00e0 jour de votre syst\u00e8me ou de Zotero, vous n'\u00eates sans doute pas\nseul : ce \"sujet chaud\" est rapidement mis en exergue par les\nadministrateurs du forum.
\nC'est aussi l'occasion de suivre les d\u00e9bats autour du d\u00e9veloppement de\nZotero.
Les administrateurs du forum mettent en avant les sujets chauds, les\nbugs, tr\u00e8s discut\u00e9s
\nLes utilisateurs de lecteurs de
Les forums et la documentation peuvent apporter des r\u00e9ponses, mais\ndans certains cas on pr\u00e9f\u00e8re \u00e9changer de vive voix avec des utilisateurs\navertis, et pouvoir obtenir des conseils et une aide personnalis\u00e9s. Si\nvous \u00eates rattach\u00e9 \u00e0 une universit\u00e9, une \u00e9cole ou un organisme de\nrecherche, contactez votre biblioth\u00e8que ou votre centre de\ndocumentation, vous trouverez s\u00fbrement un coll\u00e8gue pour vous orienter et\nvous renseigner. Certaines biblioth\u00e8ques universitaires proposent aussi,\nen plus des traditionnelles formations, des services d'aide \u00e0 Zotero (
Il peut \u00eatre utile \u00e9galement de consulter r\u00e9guli\u00e8rement l'offre du\nr\u00e9seau des Urfist (Unit\u00e9 r\u00e9gionale de formation \u00e0 l'information\nscientifique et technique) qui proposent r\u00e9guli\u00e8rement des
En bref la communaut\u00e9 Zotero, en ligne sur le forum, en r\u00e9alit\u00e9 dans\nvos biblioth\u00e8ques notamment, est l\u00e0 pour vous aider\u00a0!
","doi":"https://doi.org/10.59350/fw4bt-6j813","guid":"http://zotero.hypotheses.org/?p=1192","image":"https://zotero.hypotheses.org/files/2016/11/dennis_skley_by_nd.jpg","language":"fr","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1479859200,"rid":"bq0m6-v8k30","summary":" Mise \u00e0 jour du 2022-10-10 : Six ans presque jour pour jour apr\u00e8s la publication de ce billet, nous fermons les commentaires. ","tags":["Actualit\u00e9s","Trucs Et Astuces"],"title":"Besoin d'aide ?","updated_at":1788666749,"url":"https://zotero.hypotheses.org/1192","version":"v1"}},{"document":{"authors":[{"contributor_roles":[],"family":"Flamerie","given":"Fr\u00e9d\u00e9rique"}],"blog":{"authors":null,"community_id":"310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49","created":1708300800,"current_feed_url":null,"description":null,"doi":"https://doi.org/10.59350/zotero_fr","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49/logo","feed_format":"application/atom+xml","feed_url":"https://zotero.hypotheses.org/feed/atom/","filter":null,"generator":"WordPress","home_page_url":"https://zotero.hypotheses.org","issn":null,"language":"fra","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"zotero_fr","status":"active","subfield":"1710","title":"Le blog Zotero francophone","updated":1788191754,"use_api":true},"blog_name":"Le blog Zotero francophone","blog_slug":"zotero_fr","content_html":"Auteur : Leo Reynolds \u2013 CC-BY-SA \u2013 Source : Flickr
\nIl est grand temps d'\u00e9voquer la nouvelle version de Zotero,\nla version 5, dont certains d'entre vous ont s\u00fbrement\n
Restons-en \u00e0 la version 5 pour le moment. La page de
Auteur : Alyson Hurt \u2013 CC BY-NC \u2013 Source : Flickr
\nL'un des principaux apports de cette nouvelle version est\nincontestablement la nouvelle architecture de synchronisation.
\nLa synchronisation s\u00e9lective permet ainsi non\nseulement de choisir les biblioth\u00e8ques \u00e0 synchroniser\n(biblioth\u00e8ques\u00a0 personnelle et de groupe, nouvelle biblioth\u00e8que Mes\npublications), mais \u00e9galement de lancer la synchronisation d'une\nbiblioth\u00e8que \u00e0 la demande, depuis un menu contextuel.
\nMoins visibles mais non moins fondamentaux au quotidien, citons aussi\n:
\nNotons enfin une meilleure ergonomie pour configurer la\nsynchronisation, et la possibilit\u00e9 de dissocier d'un\nclic le compte associ\u00e9 \u00e0 une biblioth\u00e8que locale.
\nNouveaut\u00e9 beaucoup plus visible, Zotero 5 int\u00e8gre d\u00e9sormais un\nagr\u00e9gateur de flux RSS\net Atom. L'int\u00e9gration de ce puissant outil de veille permet de limiter\nla dispersion des diff\u00e9rentes \u00e9tapes de la biblio entre plusieurs\napplications ou services, et de fluidifier l'ajout des nouveaux\ndocuments rep\u00e9r\u00e9s par le biais d'une veille RSS. D'un clic les nouvelles\nentr\u00e9es sont en effet transf\u00e9r\u00e9es de la biblioth\u00e8que des flux aux\nbiblioth\u00e8ques de documents, sous la forme de documents complets avec les\nfichiers associ\u00e9s (si applicable).
\nLe menu Options (qui remplace d\u00e9sormais la roue dent\u00e9e pour\nacc\u00e9der aux Pr\u00e9f\u00e9rences) permet de configurer :
\nOn peut \u00e9galement, flux par flux :
\nAuteur : Dominik Dome \u2013 CC BY-NC-SA \u2013 Source : Flickr
\nDeux nouveaut\u00e9s facilitent la gestion des styles :\nl'installation directe des styles bibliographiques et\nla pr\u00e9sence de nouveaux liens vers le gestionnaire de\nstyles. Les styles s'installent en effet directement depuis
Comme nous l'avons d\u00e9taill\u00e9 dans un
Voici \u00e0 nouveau une modification invisible, mais d'un impact notable,\nnotamment pour la configuration de la sauvegarde de vos donn\u00e9es Zotero.\nAvec Zotero 5, si les fichiers sont toujours enregistr\u00e9s dans un\nr\u00e9pertoire Zotero, ce dernier est remont\u00e9 \u00e0 la racine du\nr\u00e9pertoire de l'utilisateur. Sur Mac et Linux, un r\u00e9pertoire de donn\u00e9es\n\u00e0 l'emplacement par d\u00e9faut pr\u00e9c\u00e9dent sera automatiquement d\u00e9plac\u00e9 au\nnouvel emplacement. Les utilisateurs de Windows pourront effectuer cette\nmodification depuis le menu Pr\u00e9f\u00e9rences > Avanc\u00e9es\n> Fichiers et dossiers.
\nCette nouvelle configuration pourra r\u00e9soudre les anomalies\nd'enregistrement des fichiers PDF joints annot\u00e9s dans une visionneuses\nexternes,
Auteur : Dennis Skley \u2013 CC BY-ND \u2013 Source : Flickr
\nA l'instar de Mendeley ou de services tels que les r\u00e9seaux sociaux\nacad\u00e9miques Academia.edu ou ResearchGate, Zotero 5 propose une\nfonctionnalit\u00e9 de profil associant page\nweb et publications en texte int\u00e9gral, gr\u00e2ce \u00e0\nla biblioth\u00e8que Mes publications.
\nOn peut ainsi facilement non seulement associer \u00e0 sa page de profil\nZotero une liste de\npublications, mais surtout publier les fichiers de texte\nint\u00e9gral. Il est d\u00e9j\u00e0 possible actuellement de partager des\nfichiers par le biais d'une biblioth\u00e8que de groupe, en d\u00e9finissant un\np\u00e9rim\u00e8tre de lecteurs plus ou moins large (administrateurs du groupe,\nmembres du groupe ou tout internaute). La nouveaut\u00e9 r\u00e9side donc\nprincipalement dans la fonction de publication : Zotero 5 permet de\npublier les fichiers sous une licence d\u00e9termin\u00e9e. Le\ndouble objectif est d'autoriser le partage public de fichiers, et\nd'envisager l'int\u00e9gration avec d'autres services telles que les\narchives institutionnelles. Si l'interop\u00e9rabilit\u00e9 avec\nORCID est \u00e0 l'\u00e9tude (voir
Un petit regret concernant Mes publications : les options de\npersonnalisation demeurent limit\u00e9es et il n'est ainsi pas possible de\nparam\u00e9trer l'ordre d'affichage des types de document. Un biologiste, par\nexemple, pourrait pr\u00e9f\u00e9rer afficher ses articles avant ses livres.
\nL'\u00e9diteur de notes profite \u00e9galement de la version 5 et voit ses\npotentialit\u00e9s augment\u00e9es, avec notamment :
\nAuteur : Andrew Malone \u2013 CC BY \u2013 Source : Flickr
\nCertains modules apportent des fonctionnalit\u00e9s compl\u00e9mentaires mais\nindispensables pour certains utilisateurs. Qu'en est-il de la\ncompatibilit\u00e9 des plus essentiels d'entre eux, \u00e0 nouveau selon\nnotre\u00a0int\u00e9r\u00eat fort subjectif ?
\nMise \u00e0 jour 2018-01-15 : Il fallait pencher pour\nl'optimisme!
Avez-vous test\u00e9 Zotero 5 ? Quelle nouvelle fonctionnalit\u00e9\nattendez-vous avec le plus d'impatience ?
","doi":"https://doi.org/10.59350/ggxvj-kpz45","guid":"http://zotero.hypotheses.org/?p=1224","image":"https://zotero.hypotheses.org/files/2017/02/leo_reynolds5.jpg","language":"fr","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1488153600,"rid":"45940-gzc30","summary":"Auteur : Leo Reynolds \u2013 CC-BY-SA \u2013 Source : Flickr Il est grand temps d'\u00e9voquer la nouvelle version de Zotero, la version 5 , dont certains d'entre vous ont s\u00fbrement install\u00e9 et test\u00e9 la version beta . L'une des principales nouveaut\u00e9s de cette mise \u00e0 jour majeure est de rendre obsol\u00e8te la cat\u00e9gorie \"Standalone\" de nos billets : Zotero sera d\u00e9sormais une application distincte , quel que soit le navigateur","tags":["Actualit\u00e9s","Plug-ins Et Apps"],"title":"Un avant-go\u00fbt de Zotero version 5","updated_at":1788666745,"url":"https://zotero.hypotheses.org/1224","version":"v1"}},{"document":{"authors":[{"contributor_roles":[],"family":"Flamerie","given":"Fr\u00e9d\u00e9rique"}],"blog":{"authors":null,"community_id":"310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49","created":1708300800,"current_feed_url":null,"description":null,"doi":"https://doi.org/10.59350/zotero_fr","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49/logo","feed_format":"application/atom+xml","feed_url":"https://zotero.hypotheses.org/feed/atom/","filter":null,"generator":"WordPress","home_page_url":"https://zotero.hypotheses.org","issn":null,"language":"fra","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"zotero_fr","status":"active","subfield":"1710","title":"Le blog Zotero francophone","updated":1788191754,"use_api":true},"blog_name":"Le blog Zotero francophone","blog_slug":"zotero_fr","content_html":"Auteur : Daniel Kulinski \u2013 CC-BY-NC-SA \u2013 Source : Flickr
\nLe blog Zotero francophone s'associe \u00e0 l'association
Dans la continuit\u00e9 de l'atelier OpenGeek de
Nous vous proposons le programme suivant :
\nLes informations d\u00e9taill\u00e9s concernant cet atelier sont disponibles
Pour participer, inscrivez-vous sur
\u00c0 tr\u00e8s bient\u00f4t !
\n*Fr\u00e9d\u00e9rique Flamerie (Blog Zotero francophone), C\u00e9lya Gruson-Daniel\n(HackYourPhD) et Franziska Heimburger (Bo\u00eete \u00e0 outils\ndes historiens).
\n*
Mise \u00e0 jour du 4 mai 2017 : Retrouvez sur
Logo cr\u00e9\u00e9 par Geoffroy Dorne
\nJeffrey Demaine & Philippe Boisvert
\n\n\n\nA review of a recent article on bibliographic coupling (BC) and conceptual similarity prompted reflection among members of a bibliometrics reading group. In this piece, they examine the validity of BC as a measure of semantic similarity, unpack the article's methodology, and discuss its conclusions, considering the broader implications of using BC to capture the semantic content of cited works.
\n\n\n\nAs part of a monthly reading club hosted by Philippe Boisvert of the Universit\u00e9 Laval, a few bibliometricians reviewed the article Bibliographic Coupling and Conceptual Similarity: Are the Bibliographically Coupled Papers also Conceptually Similar? This research by Nandy et al. (2024) casts doubt on the validity of Bibliographic Coupling (BC) as a method of capturing the semantic content of cited articles. It should be noted that questions about the usefulness of BC in identifying any meaningful relationship between publications dates back several decades. The article in question does a good job of reviewing previous studies that both support and refute the validity of BC as a measure of semantic similarity. Yet for those of us who have used BC for years, the article's conclusions are surprising.
\n\n\n\n\n\n\n\n\nBibliographic Coupling
\n
Originally proposed by Michael Kessler in 1963, the rationale behind Bibliographic Coupling (\"BC\") is simple: the more references that two articles have in common, the more likely the contents of the articles are similar. This can be measured simply by counting the number of references they share (known as \"BC strength\"). It can also be expressed as a fraction by dividing the number of overlapping references by the sum of all the unique references in the two articles (the \"Jaccard Similarity Index\").
Although it involves the manipulation of large matrices, the methodology is straightforward. The normalized Jaccard Similarity is calculated for all pairs of publications, both for BC and for a \"concept coupling\" score derived from the Dimensions database. The resulting matrices (document X document; document X concept) were then filtered to extract pairs of publications that are related both through BC and concepts, and the Jaccard Similarity values of these pairs were compared. Somewhat controversially, the authors find no correlation between the BC scores and the \"concept coupling\" weights assigned by Dimensions.
\n\n\n\nThankfully, a close reading of the details of the methodology uncovered a couple of weaknesses in the analysis that may help to explain this unexpected finding:
\n\n\n\nWhile the results presented in the article would seem to present a strong case against the meaningfulness of BC, the take-home message might be that, despite decades of use, it seems that the jury is still out. Clearly, BC is measuring something different than the concepts expressed in the Dimensions database. Perhaps both are equally valid measures of document similarity, but in completely separate ways.
\n\n\n\nConsider an analogy: the similarity of cities can be calculated based on the flight networks that connect them. It can be said that L.A. and Vancouver are coupled (from an airline's point of view) because there are direct flights to Tokyo from both. Yet the socio-economic characteristics of each city (perhaps analogous to the conceptual content of an article) are quite different. Thus, while the article by Nandy et al. (2024) demonstrates that BC and conceptual coupling are incomparable, this should not be taken as discrediting the usefulness of BC in expressing the structural or topical relatedness of publications. A prudent bibliometrician would use BC in conjunction with other measures of textual similarity.
\n\n\n\nJeffrey Demaine is an organizer of the annual Bibliometrics and Research Impact (BRIC) conference. He has extensive experience in information science, beginning with the National Research Council in Ottawa, and then the iFQ in Germany. His publications have focused on leveraging metadata to uncover patterns in research and higher education, such as Linked Literature Analysis, gender distribution across faculties and institutions, and the fractionalization of citation impact. He was the Bibliometrics and Research Impact Librarian at the University of Waterloo and McMaster University.
\n\n\n\nPhilippe Boisvert has been the Bibliometrics and Research Impact Librarian at Universit\u00e9 Laval in Quebec City, Canada, since 2022. Before that, he was a subject librarian in science and engineering since 2010. In that role, he has been involved in bibliometrics since 2014. He also has a background in Physics (a master's degree and a PhD candidature for more than two years). Since 2023, he has been running the monthly reading club of the Canadian Association of Research Libraries BIR CoP. He's also been on the Steering Committee of that CoP since that year.
\n\n\n\n Unless it states otherwise, the content of the Bibliomagician is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
DOI: https://doi.org/10.59350/bwz65-rjn21
","doi":"https://doi.org/10.59350/vmshw-eqe18","guid":"https://thebibliomagician.wordpress.com/?p=5260","language":"en","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1775001600,"reference":[{"id":"https://doi.org/10.1002/asi.5090140103","unstructured":"Kessler, M.M. (1963), Bibliographic coupling between scientific papers. American Documentation, 14: 10-25."},{"id":"https://doi.org/10.5530/jscires.20041115","unstructured":"Nandy, A., Singh, A., Gupta, V., & Singh, V. K. (2024). Bibliographic Coupling and Conceptual Similarity: Are the Bibliographically Coupled Papers also Conceptually Similar? Journal of Scientometric Research, 13(3), 706\u2013714."}],"rid":"4ktpw-xyx07","summary":"Jeffrey Demaine & Philippe Boisvert A review of a recent article on bibliographic coupling (BC) and conceptual similarity prompted reflection among members of a bibliometrics reading group.","tags":["Bibliometric","Bibliometric Study","Metrics"],"title":"A Review of \"Comparing Bibliographic Coupling and Conceptual Similarity\" \u2013 Have We Been Wrong All Along?","updated_at":1788683479,"url":"https://thebibliomagician.wordpress.com/2026/04/01/a-review-of-comparing-bibliographic-coupling-and-conceptual-similarity-have-we-been-wrong-all-along/","version":"v1"},{"authors":[{"contributor_roles":[],"family":"Price","given":"Robyn"}],"blog":{"authors":[{"name":"Bibliomagician Staff"}],"community_id":"f5c1522e-c8de-4681-a317-e32ddb61b26a","created":1780876800,"current_feed_url":null,"description":"Comment & practical guidance from the LIS-Bibliometrics community","doi":"https://doi.org/10.59350/bibliomagician","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/f5c1522e-c8de-4681-a317-e32ddb61b26a/logo","feed_format":"application/atom+xml","feed_url":"https://thebibliomagician.wordpress.com/feed/atom","filter":null,"generator":"WordPress.com","home_page_url":"https://thebibliomagician.wordpress.com","issn":null,"language":"eng","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"bibliomagician","status":"active","subfield":"3309","title":"The Bibliomagician","updated":1788480121,"use_api":true},"blog_name":"The Bibliomagician","blog_slug":"bibliomagician","content_html":"Robyn Price considers how systematic injustices in academia are present in and perpetuate in bibliometrics; and ways that the bibliometric community can address this.
\n\n\n\nWorking in bibliometrics is difficult. The part that I, and I think a lot of people in this community, find difficult is the responsibility for data about research outputs and the people who produce research.
\n\n\n\nBibliometrics requires applying an agreed value system on to the research outputs, and thus on to the people. In this recent week of global action and anger against systematic racism amid the backdrop of health and economic crisis, this difficulty has weighed on me more heavily than ever.
\n\n\n\nWe try to count a real world of people (in the UK alone, HESA counts over 210,000 working academics employed in 2018/19[1]), the organisations that employ them and the research they produce. So much of traditional research evaluation depends on this research being in the hegemonic output type (journal articles).
\n\n\n\nJournal articles are a data entity that we analyse in search of a larger narrative about production or performance of research. This is something that in reality is complicated and not always accurate: co-authorship might or might not depict real collaboration and knowledge sharing between researchers; the discipline associated with the journal might or might not depict the exact intellectual space this work contributes to; the listed authors and their authorship position might or might not relay the real story of how or by whom the work was created.
\n\n\n\nThis gap between bibliographic data and the complex reality of what it represents will be familiar to anyone who works in this area. I have been further considering how this gap between the data and the reality, the 'known unknown' that we accept when using journal articles as a proxy for telling a human story of research, is exacerbated by issues of power structures and unequal representation in academia. This link was clarified to me through a discussion with Professor Chris Jackson (Imperial College London) who spoke of his perception and experience of structural biases in academia that perpetuate biases in the academic value system.
\n\n\n\nHow can you 'assess the impact' of an article without knowing the ways authors might have benefited from or have been disadvantaged, or even been excluded entirely, by systematic inequities that the article data can never tell you? Some of the ways we treat bibliographic data directly strengthen biases. An example of this is using databases that we know to have biases, such as language[3] or geography, for analysis.
\n\n\n\nThese limitations can be seen even when we just begin to identify researchers and their outputs; the publication databases falling short of identifying outputs from all of our researcher cohorts equally before we even start to derive metrics, responsible or otherwise, from them.
\n\n\n\nHow can the bibliometric community tackle these issues? I have begun to consider how individuals in positions like me have responsibility for stopping these issues perpetuating in our practice and community. What practical things can those in such positions do to help address these issues?
\n\n\n\nI invite anyone with other ideas of ways to address this issue, or who wish to share experiences or further reading material to contribute through the comments or on the list.
\n\n\n\n[1] https://www.hesa.ac.uk/data-and-analysis/staff/working-in-he
\n\n\n\n[2] https://www.theguardian.com/education/2019/sep/12/look-at-how-white-the-academy-is-why-bame-students-arent-doing-phds
\n\n\n\n[3] https://arxiv.org/abs/2005.10732
\n\n\n\n[4] Ishaq, Dr M and Hussain, Dr AM (2019). BAME staff experiences of academic and research libraries. London: SCONUL https://www.sconul.ac.uk/page/bame-staff-experiences-of-academic-and-researchlibraries
\n\n\n\nRobyn is the Bibliometrics and Indicators Manager at Imperial College London. In this role she is responsible for managing a bibliometrics service with an emphasis on promoting responsible use of metrics. Previously, Robyn worked in the editorial teams of subscription and open access journals.
\n\n\n\n\nUnless it states other wise, the content of the Bibliomagician is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
\nDOI: https://doi.org/10.59350/bibliomagician.3582
","doi":"https://doi.org/10.59350/bibliomagician.3582","guid":"https://thebibliomagician.wordpress.com/?p=3582","image":"https://thebibliomagician.wordpress.com/wp-content/uploads/2020/06/tingey-injury-law-firm-ycdpu73kgsc-unsplash.jpg?w=1024","language":"en","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1591660800,"rid":"hc780-x4107","summary":"Robyn Price considers how systematic injustices in academia are present in and perpetuate in bibliometrics; and ways that the bibliometric community can address this. Working in bibliometrics is difficult.","tags":["Bibliometrician","Equality And Diversity","Metrics"],"title":"Truth behind the numbers?","updated_at":1788679940,"url":"https://thebibliomagician.wordpress.com/2020/06/09/the-truth-behind-the-numbers/","version":"v1"},{"authors":[{"affiliation":[{"id":"https://ror.org/0153tk833","name":"University of Virginia"}],"contributor_roles":[],"family":"Turner","given":"Stephen","url":"https://orcid.org/0000-0001-9140-9028"}],"blog":{"authors":[{"name":"Stephen Turner"}],"community_id":"382941a7-2ffa-41df-8bbb-5f772188517f","created":1780876800,"current_feed_url":null,"description":"A practicing data scientist's take on AI, genomics, biosecurity, and the ways AI is reshaping how science gets done. Weekly updates from the field. Occasional notes on programming.","doi":"https://doi.org/10.59350/stephenturner","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/382941a7-2ffa-41df-8bbb-5f772188517f/logo","feed_format":"application/rss+xml","feed_url":"https://blog.stephenturner.us/feed","filter":null,"generator":"Substack","home_page_url":"https://blog.stephenturner.us","issn":null,"language":"eng","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"stephenturner","status":"active","subfield":"1311","title":"Paired Ends","updated":1788599012,"use_api":null},"blog_name":"Paired Ends","blog_slug":"stephenturner","content_html":"I published a preprint last week. It mostly focuses on what biosecurity evaluations of AI models measure and how far those measurements sit from what you might call an estimate of real-world risk.
AI Biosecurity Benchmarks and Real-World Risk (2026). Available at SSRN: https://ssrn.com/abstract=7358438 or dx.doi.org/10.2139/ssrn.7358438
I've spent about 15 years in and adjacent to biodefense. At first as an academic researcher when I got my first faculty position here in the School of Medicine, then for many years at Signature Science where the badge said industry but the work was for the US government. Now I'm back in academia at the UVA School of Data Science, building out our own AIxBio and biosecurity research program along with other colleagues here at SDS and in our National Security Data and Policy Institute.
Over the past year since I returned to UVA I've been closely following the AIxBio and biosecurity literature: new benchmarks/evals, human uplift trials, synthesis screening results, unlearning and pretraining-filter experiments, developer preparedness frameworks, policy proposals. My thinking was that the many pages of notes on the important work happening here could be a starting point for developing a really interesting upper level elective or graduate course here in SDS. Many of these notes became posts here on this newsletter. The rest piled up in my Zotero library, full of notes and highlights attached to each of the entries. I decided to package up everything I had into a single review, mostly on the theme of how benchmark scores connect to real-world risk and what work remains to be done. I started writing this mostly as a primer for new people joining my lab, but then figured it may be of broader interest.
The list of groups doing this work or funding it is long, and the reference list includes work from Active Site, SecureBio, Sentinel Bio, Signature Science, IBBIS, LatchBio, RAND Center on AI, Security, and Technology (CAST), Hewlett Foundation, Johns Hopkins Center for Health Security, METR, Epoch AI, UK AI Security Institute, Frontier Model Forum, Nuclear Threat Initiative, International Gene Synthesis Consortium, Sequence Biosecurity Risk Consortium, Aclid, Centre for Long-Term Resilience, NIST Center for AI Standards and Innovation (CAISI), Georgetown CSET, all the frontier labs, and many, many others.
I don't love offering a TL;DR on a review paper since synthesizing all the interesting bits from hundreds of papers is kind of the whole point of writing one. But it might just be TL, so in case you DR, here's a one-line summary:
Really great people at really great organizations are doing really great work at the intersection of AI and biosecurity.
I tried to organize as much of it as I could into one place, with sincere apologies to anyone whose work in this space I omitted.1 If you'd be willing to peer review this when I try to publish it, email me.
And even more sincere apologies to any work I cited here but mischaracterized. The last page of the paper has the most detailed AI disclosure I've ever read or written. On an early draft I gave an army of Claude agents the manuscript Quarto file, full access to my Zotero library and PDF exports alongside the BiBTeX file with everything I cited, and asked for rigorous fact checking of everything I wrote and every statistic I cited. It worked well, until it didn't \u2014 because of the nature of the subject matter being biosecurity and discussion of dual-use technology, adversarial red-teaming, safeguards, screening evasion, etc., I ended up hitting refusals from nearly every model I attempted to use in this fact-checking agentic workflow. I eventually gave up and did the fact-checking and proofreading the old fashioned way (re-reading, and re-re-reading), but I'm human and I make human mistakes. Hopefully anything I didn't catch will get surfaced during peer review. See the last page of the paper for details.
Il y a deux ans environ, le projet Zotero a obtenu une bourse pour
Nous relayons ici
Nous vous l'annoncions il y a quelques mois: le nouveau bouton de\ncapture, qui venait d'\u00eatre\nmis en place sur Firefox, allait \u00eatre mis en place pour d'autres\nnavigateurs. C'est d\u00e9sormais chose faite pour Google Chrome\u00a0! (Les\nutilisateurs de Safari doivent encore patienter un peu.)
\n\u00c0 noter: Ce billet est une adaptation de l'
Petit rappel : jusque-l\u00e0, si l'extension Zotero pour Chrome d\u00e9tectait\nune r\u00e9f\u00e9rence sur une page web, il affichait une ic\u00f4ne dans la barre\nd'adresse. Pour les pages sur lesquelles l'extension ne pouvait pas\ntrouver de r\u00e9f\u00e9rences, on pouvait faire un clic droit sur la page et\nchoisir \u00abSave Page to Zotero\u00bb, pour ajouter un document Page\nWeb et une capture dans sa biblioth\u00e8que.
\nDepuis la derni\u00e8re version de l'extension Chrome, il est possible\nd'utiliser le m\u00eame bouton, qui figure en permanence dans la\nbarre d'outils, pour enregistrer un document depuis n'importe quelle\npage :
\nSi l'extension d\u00e9tecte une r\u00e9f\u00e9rence, le bouton affiche la m\u00eame ic\u00f4ne\nque par le pass\u00e9: un livre, un journal, un article de revue, un dossier,\netc. Sur toute autre page, vous verrez une ic\u00f4ne grise qui permettra\nl'enregistrement d'un document Page Web, avec une capture et les\ninformations les plus basiques la concernant (titre, URL, date de\nconsultation).
\nCe bouton unique et simplifi\u00e9 constitue l'avantage principal apport\u00e9\npar cette mise \u00e0 jour. Deux autres nouveaut\u00e9s font leur apparition.
\nD'une part, un menu d\u00e9roulant permet de choisir d'autres\nmani\u00e8res d'importer les r\u00e9f\u00e9rences. En g\u00e9n\u00e9ral, le clic sur le\nbouton reste la meilleure solution. Dans certains cas, le menu d\u00e9roulant\napporte quelques avantages, que vous pouvez d\u00e9couvrir dans le billet que\nnous avions consacr\u00e9 \u00e0 la version Firefox:
D'autre part, il est d\u00e9sormais possible d'enregistrer un PDF\ndans Zotero par un seul clic.
\nJusque-l\u00e0, l'enregistrement d'un PDF n\u00e9cessitait de le faire glisser\ndepuis la barre d'adresse pour le d\u00e9poser dans Zotero ou de\nl'enregistrer en local, puis de l'ajouter manuellement dans Zotero.\nD\u00e9sormais, lorsque vous affichez un fichier PDF dans Chrome, il vous\nsuffit de cliquer sur le nouveau bouton de capture dans la barre\nd'outils pour enregistrer le PDF dans Zotero.1\nIl est cependant import\u00e9 comme simple fichier PDF, sans \u00eatre attach\u00e9 \u00e0\nune r\u00e9f\u00e9rence bibliographique plus compl\u00e8te. Pour cr\u00e9er une telle\nr\u00e9f\u00e9rence, vous pouvez soit tenter de \u00abR\u00e9cup\u00e9rer les m\u00e9tadonn\u00e9es du\nPDF\u00bb, soit \u00abCr\u00e9er un document parent\u00bb \u00e0 remplir manuellement. Ces deux\noptions sont accessibles par un clic-droit sur le PDF. Dans une\nprochaine version, Zotero tentera de cr\u00e9er un \u00e9l\u00e9ment parent\nautomatiquement.
\nEn d\u00e9pit du nouveau bouton, certaines limitations\npersistent. Notons en deux. Premi\u00e8rement, tant que la page web\nn'a pas fini de charger dans Chrome, l'extension Zotero n'affiche que\nl'ic\u00f4ne grise de capture de page web, m\u00eame si la page contient une ou\nplusieurs r\u00e9f\u00e9rences bibliographiques. Deuxi\u00e8mement, la capture de page\nweb ne fonctionne pas si Zotero Standalone n'est pas ouvert. L\u00e0 aussi,\nune am\u00e9lioration est pr\u00e9vue et une future version permettra\nd'enregistrer des pages web directement dans votre compte zotero.org\nquand Standalone n'est pas ouvert (comme c'est d\u00e9j\u00e0 le cas pour les\nautres types de r\u00e9f\u00e9rences).
\nSi vous avez install\u00e9 la derni\u00e8re version de Chrome, votre extension\nZotero devrait \u00eatre mise \u00e0 jour automatiquement. Si vous n'utilisez pas\nactuellement Zotero avec Chrome, vous pouvez
1. \u00c0 condition toutefois que vous disposiez de\nla version 4.0.29 ou sup\u00e9rieure de Zotero Standalone.
Lorsque vous enregistrez des documents dans Zotero, toutes les\ninformations ne sont pas forc\u00e9ment bien format\u00e9es, et il est parfois\nn\u00e9cessaire de proc\u00e9der \u00e0 des corrections manuelles. Zotero permet\nd'effectuer tr\u00e8s facilement de petites retouches.
\nNous allons alors voir :
\nLes options d'inversion du nom/pr\u00e9nom et de modification de la casse\ndu titre s'affichent par un simple clic-droit (ctrl + clic\ngauche pour les utilisateurs de Mac) dans le contenu des champs\nconcern\u00e9s.
\nCette fonctionnalit\u00e9 est disponible pour tous les champs de type\nauteur (y compris Auteur du livre, \u00c9diteur, Traducteur, Compositeur,\netc).
\nLa \u00ab\u00a0Bo\u00eete \u00e0 outils des historiens\u00a0\u00bb a pr\u00e9sent\u00e9 en 2011
<i> et </i> pour des\nitaliques<b> et </b> pour mettre en\ngras<sub> et </sub> pour mettre en\nindice<sup> et </sup> pour mettre en\nexposant<span style=\"font-variant:small-caps;\"> et\n</span> pour mettre en petites majusculesSoulignons que ces modifications s'envisagent uniquement pour une\npartie d'un champ : c'est par exemple utile si le titre d'un article\ncite le titre d'un ouvrage, qui devrait donc figurer en italique. En\nrevanche, si vous souhaitez que l'ensemble du titre soit en italique,\nchoisissez un style bibliographique pr\u00e9voyant ce type de formatage, ou\ncr\u00e9ez-en un int\u00e9grant ce param\u00e8tre.
\nDans un pr\u00e9c\u00e9dent billet du blog, nous avons d\u00e9j\u00e0 pr\u00e9sent\u00e9\nl'existence d'une fonctionnalit\u00e9 permettant de corriger la casse des\nchamps de type titre, tels que \u00ab\u00a0Titre abr\u00e9g\u00e9\u00a0\u00bb, \u00ab\u00a0Titre du livre\u00a0\u00bb,\n\u00ab\u00a0Publication\u00a0\u00bb, etc. Cette fonctionnalit\u00e9 a comme utilit\u00e9 d'appliquer\nune r\u00e8gle de majuscules choisie.
\nLe menu affich\u00e9 au clic-droit (ctrl + clic gauche pour les\nutilisateurs de Mac) propose deux options :
\nRappelons que Zotero est une base de donn\u00e9es, et\nqu'\u00e0 ce titre elle n'a pas vocation \u00e0 traiter la mise en\nforme, mais \u00e0 stocker du contenu. Ce contenu\npourra ensuite \u00eatre mis en forme gr\u00e2ce aux styles bibliographiques CSL.\nDans cette perspective, afin que la mise en forme automatique param\u00e9tr\u00e9e\npar le style bibliographique soit la plus homog\u00e8ne et syst\u00e9matique, on a\ntout int\u00e9r\u00eat \u00e0 stocker aussi un contenu le plus homog\u00e8ne possible. Le\nrisque est sinon de cr\u00e9er des exceptions dont le style ne tiendra pas\ncompte, ce qui engendrera des anomalies qu'il faudra corriger \u00e0 la\nmain.
\nL'option \u00ab\u00a0Transformer le texte\u00a0\u00bb permet ainsi non seulement de\ncorriger des erreurs manifestes de typographie (lorsque le champ a \u00e9t\u00e9\nimport\u00e9 tout en capitales par exemple), mais aussi d'uniformiser le\nformatage d'un champ commun \u00e0 tous les enregistrements, en l'occurrence\ntout champ de type \u00ab\u00a0Titre\u00a0\u00bb.
\nCette option permet aussi d'offrir une solution de compromis aux\nutilisateurs qui souhaitent apporter des retouches ponctuelles \u00e0\ncertains titres de leur biblioth\u00e8que, sans pour autant modifier le\nparam\u00e9trage du style CSL utilis\u00e9 (voir le Bonus ci-dessous).\nC'est une mani\u00e8re d'introduire un peu de mise en forme dans les\ninformations contenues dans la base.
\nTout comme les consignes des \u00e9diteurs, les conventions typographiques\n(qui d\u00e9pendent en grande partie de diff\u00e9rentes cultures linguistiques)\nsont tr\u00e8s diverses. Pour cette raison, dans la plupart des cas, les\nstyles CSL ne s'occupent pas de mettre en forme la casse des titres, de\nfa\u00e7on \u00e0 laisser \u00e0 chacun la possibilit\u00e9 d'indiquer sa pr\u00e9f\u00e9rence au cas\npar cas lors de l'enregistrement de chacune des r\u00e9f\u00e9rences.
\nDonc, \u00e0 moins que vous n'envisagiez de modifier ce fonctionnement\npour un des styles que vous utilisez (voir le Bonus\nci-dessous), la solution la plus simple consiste \u00e0 placer les capitales\ndu titre selon votre convenance. De cette mani\u00e8re, vous serez s\u00fbr de les\nvoir appara\u00eetre tels quels dans vos bibliographies. Concr\u00e8tement, en\nfran\u00e7ais, le mode phrase s'av\u00e9rera dans la quasi\ntotalit\u00e9 des cas le meilleur choix, \u00e9ventuellement corrig\u00e9 \u00e0 la main\npour les noms propres, et ponctuellement combin\u00e9 avec le mode\ntitre pour les r\u00e9f\u00e9rences anglophones.
\nIl est aussi possible d'utiliser les styles CSL pour prendre en\ncharge la casse du titre. Nous abordons l\u00e0 un domaine, la modification\ndes styles CSL, qui peut \u00eatre \u00e9tranger \u00e0 certains d'entre vous et vous\nsembler, sinon \u00e9sot\u00e9rique, du moins trop informatique pour vous. Or il\nn'est nul besoin de comp\u00e9tences informatiques particuli\u00e8res pour\nmodifier et cr\u00e9er des styles CSL, mais d'un peu de temps et de patience\npour se familiariser avec le langage CSL, bas\u00e9 sur XML. Des ressources\nen ligne peuvent vous aider \u00e0 d\u00e9buter :
\nSi vous d\u00e9butez, utiliser l'\u00e9diteur de styles int\u00e9gr\u00e9 \u00e0 Zotero\nlimitera les mauvaises manipulations qui peuvent rendre un style\ninutilisable ou incoh\u00e9rent (balise mal ferm\u00e9e ou incompatibilit\u00e9\nd'instruction par exemple).
\nSi vous choisissez d'assurer la gestion de la casse des titres gr\u00e2ce\nau param\u00e9trage de vos styles CSL, la r\u00e9ponse \u00e0 la question \"Quelle\noption choisir en d\u00e9finitive?\" change alors. Il convient dans ce cas de\n:
\nRentrons dans le vif du sujet. Un param\u00e8tre du style bibliographique\nCSL, l'attribut text-case avec pour valeur\ntitle, permet d'appliquer le mode titre\nlors de la r\u00e9daction. Et il s'av\u00e8re bien plus simple de fonctionner dans\nce sens, i. e. stockage en mode phrase et\nr\u00e9daction en mode titre si n\u00e9cessaire, que dans\nl'autre. Dans l'autre sens vous perdrez en effet, lorsque vous r\u00e9digerez\nen mode phrase, les majuscules \u00e0 l'initiale des noms\npropres. L'attribut text-case valeur sentence\nremplacera en effet toutes les majuscules initiales par des minuscules,\ny compris celles des noms propres.
Nous avons traduit ici approximativement les recommandations de la
CSL processors don't recognize proper nouns. As a result, strings\nin sentence case can be accurately converted to title case, but not vice\nversa. For this reason, it is generally preferable to store strings such\nas titles in sentence case, and only use text-case if\na style desires another case.
\nSoulignons que la conversion ne prend en compte que les cha\u00eenes de\ncaract\u00e8re en anglais et ignore les mots vides tels que \u00ab\u00a0and\u00a0\u00bb, \u00ab\u00a0the\u00a0\u00bb,\netc. Comment Zotero identifie-t-il les cha\u00eenes de caract\u00e8re comme en\nanglais et donc \u00e0 convertir\u00a0? Sont consid\u00e9r\u00e9s comme en anglais tous les\nmots d'une r\u00e9f\u00e9rence bibliographique\u00a0:
\n| \n | \n |
Ajoutons que l'attribut text-case n'a pas pour seules\nvaleurs possibles title et sentence. Il peut\n\u00e9galement \u00eatre qualifi\u00e9 par les valeurs suivantes.
lowercase : restitue le texte en lettres de\nbas-de-casse.uppercase : restitue le texte en lettres\ncapitales.capitalize-first : le premier caract\u00e8re du premier mot\nest restitu\u00e9 par une lettre capitale si le mot est en bas-de-casse ; les\nautres lettres capitales pr\u00e9sentes dans le titre sont conserv\u00e9es.\nL'attribut text-case=\"sentence\" supprime ces capitales pour\nne conserver que celle initiale.capitalize-all : les initiales de tous les mots sont\nrestitu\u00e9es en lettres capitales, y compris celles des mots vides, \u00e0 la\ndiff\u00e9rence de l'attribut text-case=\"title\" qui ignore les\nmots vides.Mais la modification d'un style bibliographique est un autre sujet,\ndans lequel nous avons fait une br\u00e8ve incursion avec l'attribut\ntext-case, et que nous aurons s\u00fbrement l'occasion d'\u00e9voquer\nprochainement. Quelles sont vos attentes en la mati\u00e8re\u00a0? Sur quels\npoints souhaitez-vous des \u00e9clairages ou des conseils\u00a0?
\u00a0
","doi":"https://doi.org/10.59350/6cwc1-tyy80","guid":"http://zotero.hypotheses.org/?p=760","image":"https://zotero.hypotheses.org/files/2015/07/daniel_kulinski.jpg","language":"fr","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1473206400,"rid":"jmxv7-w9e29","summary":"Auteur : Daniel Kulinski \u2013 CC-BY-NC-SA \u2013 Source : Flickr Lorsque vous enregistrez des documents dans Zotero, toutes les informations ne sont pas forc\u00e9ment bien format\u00e9es, et il est parfois n\u00e9cessaire de proc\u00e9der \u00e0 des corrections manuelles. Zotero permet d'effectuer tr\u00e8s facilement de petites retouches.","tags":["Styles Et CSL","Trucs Et Astuces"],"title":"Nettoyer les r\u00e9f\u00e9rences collect\u00e9es, quelques astuces","updated_at":1788666758,"url":"https://zotero.hypotheses.org/760","version":"v1"},{"authors":[{"contributor_roles":[],"name":"Collectif"}],"blog":{"authors":null,"community_id":"310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49","created":1708300800,"current_feed_url":null,"description":null,"doi":"https://doi.org/10.59350/zotero_fr","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49/logo","feed_format":"application/atom+xml","feed_url":"https://zotero.hypotheses.org/feed/atom/","filter":null,"generator":"WordPress","home_page_url":"https://zotero.hypotheses.org","issn":null,"language":"fra","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"zotero_fr","status":"active","subfield":"1710","title":"Le blog Zotero francophone","updated":1788191754,"use_api":true},"blog_name":"Le blog Zotero francophone","blog_slug":"zotero_fr","content_html":"Auteur : Alexandra guerson – CC-BY-NC-ND – Source : Flickr
S’informer en ligne en lisant les blogs ou en consultant les forums, c’est bien. Mais se rencontrer, c’est souvent tr\u00e8s b\u00e9n\u00e9fique. Dans cet esprit, nous vous signalons un \u00e9v\u00e9nement organis\u00e9 \u00e0 la fin du mois \u00e0 Paris.
\nA l’occasion de la Semaine internationale du libre acc\u00e8s, l’association HackYourPhD consacre l’un de ses ateliers OpenGeek \u00e0 Zotero. Au cours de cette s\u00e9ance de “culture g\u00e9n\u00e9rale geek” de 2h vous pourrez ainsi :
\nPour participer, inscrivez-vous sur Eventbrite et rendez-vous \u00e0 la Paillasse au sous-sol (226 rue St Denis 75002 Paris) le samedi 29 octobre \u00e0 partir de 16h30 avec C\u00e9lya Gruson-Daniel comme formatrice.
\nMise \u00e0 jour du 25 novembre 2016 : Retrouvez sur GitHub la fiche r\u00e9capitulative de la s\u00e9ance, avec un tr\u00e8s riche exemple d’organisation de biblioth\u00e8que Zotero et de nombreux liens vers des ressources.
\nLogo cr\u00e9\u00e9 par Geoffroy Dorne
Mise \u00e0 jour du 2022-10-10 :\nSix ans presque jour pour jour apr\u00e8s la publication de ce billet,\nnous fermons les commentaires. Ce billet indique en effet comment\ntrouver de l'aide :
\nDes lecteurs du billet, probablement arriv\u00e9s suite \u00e0 une\nrecherche d'aide sur un moteur de recherche, posant souvent des\nquestions pr\u00e9cises dans les commentaires, nous fermons ces derniers. Le\nforum Zotero, contrairement aux commentaires de ce blog, permet la\nconstruction d'une base commune de connaissances.
\nMise \u00e0 jour du 2020-06-20 : la\ntraduction fran\u00e7aise de la page \"
Mise \u00e0 jour du 2018-09-26 : nous vous\nrecommandons de lire \u00e0 la suite de ce billet la page\u00a0
Auteur : Dennis Skley \u2013 CC-BY-ND \u2013 Source : Flickr
\nQue l'on soit un utilisateur d\u00e9butant ou averti de Zotero, il nous\narrive tous \u00e0 un moment ou \u00e0 un autre de ne pas trouver de r\u00e9ponse \u00e0 une\nquestion li\u00e9e \u00e0 l'utilisation du logiciel. Nous vous proposons ici\nquelques pistes pour trouver l'aide la plus adapt\u00e9e.
\nLe site officiel Zotero propose une abondante documentation qui\ndevrait r\u00e9pondre \u00e0 la plupart de vos questions si vous d\u00e9butez. La\nmajeure partie de la documentation est disponible
Dans le menu de Zotero, cliquer sur Assistance et\ndocumentation vous am\u00e8ne sur la page d'accueil de cette\ndocumentation.
\nPasser par le menu de Zotero renvoie sur zotero.org/support
\nIl est rare que l'on soit le premier \u00e0 \u00eatre confront\u00e9 \u00e0 la difficult\u00e9\nqui nous bloque ou \u00e0 l'interrogation qui nous est venue, qu'il s'agisse\nd'un param\u00e9trage pour l'enregistrement des PDF (comment enregistrer\ntoujours les PDF haute r\u00e9solution sur la plateforme de l'ACS\u00a0?) ou d'un\nstyle bibliographique (comment mentionner le titre d'un num\u00e9ro sp\u00e9cial\ndans la r\u00e9f\u00e9rence d'un article\u00a0?). Le
Enfin, bien souvent, si des bugs vous semblent appara\u00eetre suite \u00e0 une\nmise \u00e0 jour de votre syst\u00e8me ou de Zotero, vous n'\u00eates sans doute pas\nseul : ce \"sujet chaud\" est rapidement mis en exergue par les\nadministrateurs du forum.
\nC'est aussi l'occasion de suivre les d\u00e9bats autour du d\u00e9veloppement de\nZotero.
Les administrateurs du forum mettent en avant les sujets chauds, les\nbugs, tr\u00e8s discut\u00e9s
\nLes utilisateurs de lecteurs de
Les forums et la documentation peuvent apporter des r\u00e9ponses, mais\ndans certains cas on pr\u00e9f\u00e8re \u00e9changer de vive voix avec des utilisateurs\navertis, et pouvoir obtenir des conseils et une aide personnalis\u00e9s. Si\nvous \u00eates rattach\u00e9 \u00e0 une universit\u00e9, une \u00e9cole ou un organisme de\nrecherche, contactez votre biblioth\u00e8que ou votre centre de\ndocumentation, vous trouverez s\u00fbrement un coll\u00e8gue pour vous orienter et\nvous renseigner. Certaines biblioth\u00e8ques universitaires proposent aussi,\nen plus des traditionnelles formations, des services d'aide \u00e0 Zotero (
Il peut \u00eatre utile \u00e9galement de consulter r\u00e9guli\u00e8rement l'offre du\nr\u00e9seau des Urfist (Unit\u00e9 r\u00e9gionale de formation \u00e0 l'information\nscientifique et technique) qui proposent r\u00e9guli\u00e8rement des
En bref la communaut\u00e9 Zotero, en ligne sur le forum, en r\u00e9alit\u00e9 dans\nvos biblioth\u00e8ques notamment, est l\u00e0 pour vous aider\u00a0!
","doi":"https://doi.org/10.59350/fw4bt-6j813","guid":"http://zotero.hypotheses.org/?p=1192","image":"https://zotero.hypotheses.org/files/2016/11/dennis_skley_by_nd.jpg","language":"fr","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1479859200,"rid":"bq0m6-v8k30","summary":" Mise \u00e0 jour du 2022-10-10 : Six ans presque jour pour jour apr\u00e8s la publication de ce billet, nous fermons les commentaires. ","tags":["Actualit\u00e9s","Trucs Et Astuces"],"title":"Besoin d'aide ?","updated_at":1788666749,"url":"https://zotero.hypotheses.org/1192","version":"v1"},{"authors":[{"contributor_roles":[],"family":"Flamerie","given":"Fr\u00e9d\u00e9rique"}],"blog":{"authors":null,"community_id":"310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49","created":1708300800,"current_feed_url":null,"description":null,"doi":"https://doi.org/10.59350/zotero_fr","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49/logo","feed_format":"application/atom+xml","feed_url":"https://zotero.hypotheses.org/feed/atom/","filter":null,"generator":"WordPress","home_page_url":"https://zotero.hypotheses.org","issn":null,"language":"fra","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"zotero_fr","status":"active","subfield":"1710","title":"Le blog Zotero francophone","updated":1788191754,"use_api":true},"blog_name":"Le blog Zotero francophone","blog_slug":"zotero_fr","content_html":"Auteur : Leo Reynolds \u2013 CC-BY-SA \u2013 Source : Flickr
\nIl est grand temps d'\u00e9voquer la nouvelle version de Zotero,\nla version 5, dont certains d'entre vous ont s\u00fbrement\n
Restons-en \u00e0 la version 5 pour le moment. La page de
Auteur : Alyson Hurt \u2013 CC BY-NC \u2013 Source : Flickr
\nL'un des principaux apports de cette nouvelle version est\nincontestablement la nouvelle architecture de synchronisation.
\nLa synchronisation s\u00e9lective permet ainsi non\nseulement de choisir les biblioth\u00e8ques \u00e0 synchroniser\n(biblioth\u00e8ques\u00a0 personnelle et de groupe, nouvelle biblioth\u00e8que Mes\npublications), mais \u00e9galement de lancer la synchronisation d'une\nbiblioth\u00e8que \u00e0 la demande, depuis un menu contextuel.
\nMoins visibles mais non moins fondamentaux au quotidien, citons aussi\n:
\nNotons enfin une meilleure ergonomie pour configurer la\nsynchronisation, et la possibilit\u00e9 de dissocier d'un\nclic le compte associ\u00e9 \u00e0 une biblioth\u00e8que locale.
\nNouveaut\u00e9 beaucoup plus visible, Zotero 5 int\u00e8gre d\u00e9sormais un\nagr\u00e9gateur de flux RSS\net Atom. L'int\u00e9gration de ce puissant outil de veille permet de limiter\nla dispersion des diff\u00e9rentes \u00e9tapes de la biblio entre plusieurs\napplications ou services, et de fluidifier l'ajout des nouveaux\ndocuments rep\u00e9r\u00e9s par le biais d'une veille RSS. D'un clic les nouvelles\nentr\u00e9es sont en effet transf\u00e9r\u00e9es de la biblioth\u00e8que des flux aux\nbiblioth\u00e8ques de documents, sous la forme de documents complets avec les\nfichiers associ\u00e9s (si applicable).
\nLe menu Options (qui remplace d\u00e9sormais la roue dent\u00e9e pour\nacc\u00e9der aux Pr\u00e9f\u00e9rences) permet de configurer :
\nOn peut \u00e9galement, flux par flux :
\nAuteur : Dominik Dome \u2013 CC BY-NC-SA \u2013 Source : Flickr
\nDeux nouveaut\u00e9s facilitent la gestion des styles :\nl'installation directe des styles bibliographiques et\nla pr\u00e9sence de nouveaux liens vers le gestionnaire de\nstyles. Les styles s'installent en effet directement depuis
Comme nous l'avons d\u00e9taill\u00e9 dans un
Voici \u00e0 nouveau une modification invisible, mais d'un impact notable,\nnotamment pour la configuration de la sauvegarde de vos donn\u00e9es Zotero.\nAvec Zotero 5, si les fichiers sont toujours enregistr\u00e9s dans un\nr\u00e9pertoire Zotero, ce dernier est remont\u00e9 \u00e0 la racine du\nr\u00e9pertoire de l'utilisateur. Sur Mac et Linux, un r\u00e9pertoire de donn\u00e9es\n\u00e0 l'emplacement par d\u00e9faut pr\u00e9c\u00e9dent sera automatiquement d\u00e9plac\u00e9 au\nnouvel emplacement. Les utilisateurs de Windows pourront effectuer cette\nmodification depuis le menu Pr\u00e9f\u00e9rences > Avanc\u00e9es\n> Fichiers et dossiers.
\nCette nouvelle configuration pourra r\u00e9soudre les anomalies\nd'enregistrement des fichiers PDF joints annot\u00e9s dans une visionneuses\nexternes,
Auteur : Dennis Skley \u2013 CC BY-ND \u2013 Source : Flickr
\nA l'instar de Mendeley ou de services tels que les r\u00e9seaux sociaux\nacad\u00e9miques Academia.edu ou ResearchGate, Zotero 5 propose une\nfonctionnalit\u00e9 de profil associant page\nweb et publications en texte int\u00e9gral, gr\u00e2ce \u00e0\nla biblioth\u00e8que Mes publications.
\nOn peut ainsi facilement non seulement associer \u00e0 sa page de profil\nZotero une liste de\npublications, mais surtout publier les fichiers de texte\nint\u00e9gral. Il est d\u00e9j\u00e0 possible actuellement de partager des\nfichiers par le biais d'une biblioth\u00e8que de groupe, en d\u00e9finissant un\np\u00e9rim\u00e8tre de lecteurs plus ou moins large (administrateurs du groupe,\nmembres du groupe ou tout internaute). La nouveaut\u00e9 r\u00e9side donc\nprincipalement dans la fonction de publication : Zotero 5 permet de\npublier les fichiers sous une licence d\u00e9termin\u00e9e. Le\ndouble objectif est d'autoriser le partage public de fichiers, et\nd'envisager l'int\u00e9gration avec d'autres services telles que les\narchives institutionnelles. Si l'interop\u00e9rabilit\u00e9 avec\nORCID est \u00e0 l'\u00e9tude (voir
Un petit regret concernant Mes publications : les options de\npersonnalisation demeurent limit\u00e9es et il n'est ainsi pas possible de\nparam\u00e9trer l'ordre d'affichage des types de document. Un biologiste, par\nexemple, pourrait pr\u00e9f\u00e9rer afficher ses articles avant ses livres.
\nL'\u00e9diteur de notes profite \u00e9galement de la version 5 et voit ses\npotentialit\u00e9s augment\u00e9es, avec notamment :
\nAuteur : Andrew Malone \u2013 CC BY \u2013 Source : Flickr
\nCertains modules apportent des fonctionnalit\u00e9s compl\u00e9mentaires mais\nindispensables pour certains utilisateurs. Qu'en est-il de la\ncompatibilit\u00e9 des plus essentiels d'entre eux, \u00e0 nouveau selon\nnotre\u00a0int\u00e9r\u00eat fort subjectif ?
\nMise \u00e0 jour 2018-01-15 : Il fallait pencher pour\nl'optimisme!
Avez-vous test\u00e9 Zotero 5 ? Quelle nouvelle fonctionnalit\u00e9\nattendez-vous avec le plus d'impatience ?
","doi":"https://doi.org/10.59350/ggxvj-kpz45","guid":"http://zotero.hypotheses.org/?p=1224","image":"https://zotero.hypotheses.org/files/2017/02/leo_reynolds5.jpg","language":"fr","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","published_at":1488153600,"rid":"45940-gzc30","summary":"Auteur : Leo Reynolds \u2013 CC-BY-SA \u2013 Source : Flickr Il est grand temps d'\u00e9voquer la nouvelle version de Zotero, la version 5 , dont certains d'entre vous ont s\u00fbrement install\u00e9 et test\u00e9 la version beta . L'une des principales nouveaut\u00e9s de cette mise \u00e0 jour majeure est de rendre obsol\u00e8te la cat\u00e9gorie \"Standalone\" de nos billets : Zotero sera d\u00e9sormais une application distincte , quel que soit le navigateur","tags":["Actualit\u00e9s","Plug-ins Et Apps"],"title":"Un avant-go\u00fbt de Zotero version 5","updated_at":1788666745,"url":"https://zotero.hypotheses.org/1224","version":"v1"},{"authors":[{"contributor_roles":[],"family":"Flamerie","given":"Fr\u00e9d\u00e9rique"}],"blog":{"authors":null,"community_id":"310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49","created":1708300800,"current_feed_url":null,"description":null,"doi":"https://doi.org/10.59350/zotero_fr","favicon":"https://rogue-scholar.org/api/communities/310eb31b-74ce-47d8-9f4f-7ae4dae66b49/logo","feed_format":"application/atom+xml","feed_url":"https://zotero.hypotheses.org/feed/atom/","filter":null,"generator":"WordPress","home_page_url":"https://zotero.hypotheses.org","issn":null,"language":"fra","license":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode","prefix":"10.59350","relative_url":null,"secure":true,"slug":"zotero_fr","status":"active","subfield":"1710","title":"Le blog Zotero francophone","updated":1788191754,"use_api":true},"blog_name":"Le blog Zotero francophone","blog_slug":"zotero_fr","content_html":"Auteur : Daniel Kulinski \u2013 CC-BY-NC-SA \u2013 Source : Flickr
\nLe blog Zotero francophone s'associe \u00e0 l'association
Dans la continuit\u00e9 de l'atelier OpenGeek de
Nous vous proposons le programme suivant :
\nLes informations d\u00e9taill\u00e9s concernant cet atelier sont disponibles
Pour participer, inscrivez-vous sur
\u00c0 tr\u00e8s bient\u00f4t !
\n*Fr\u00e9d\u00e9rique Flamerie (Blog Zotero francophone), C\u00e9lya Gruson-Daniel\n(HackYourPhD) et Franziska Heimburger (Bo\u00eete \u00e0 outils\ndes historiens).
\n*
Mise \u00e0 jour du 4 mai 2017 : Retrouvez sur
Logo cr\u00e9\u00e9 par Geoffroy Dorne
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